Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms