Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc94Q9D6J3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms