Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cmtm5Q9D6G9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm5Q9D6G9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms