Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc9bQ9D6E4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms