Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms