Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ShpkQ9D5J6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms