Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrameQ9D4Z5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrameQ9D4Z5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrameQ9D4Z5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrameQ9D4Z5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrameQ9D4Z5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms