Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms