Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcc1Q9D4H2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms