Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam90a1bQ9D4F3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms