Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms