Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx29Q9D3S3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Snx29Q9D3S3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx29Q9D3S3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms