Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnal2Q9D3R6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms