Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a4cQ9D3F6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms