Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms