Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx20Q9D2Y5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms