Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fndc8Q9D2H8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms