Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arv1Q9D0U9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms