Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms