Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem88Q9D0N8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem88Q9D0N8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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