Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp2Q9CYZ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms