Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SdhdQ9CXV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SdhdQ9CXV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms