Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CXL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CXL3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CXL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms