Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mgme1Q9CXC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mgme1Q9CXC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms