Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms