Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms