Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx10Q9CWT3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms