Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly6kQ9CWP4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly6kQ9CWP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms