Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb2bQ9CWF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms