Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sycp2Q9CUU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sycp2Q9CUU3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Sycp2Q9CUU3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms