Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a2Q9CTG6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms