Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ykt6Q9CQW1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms