Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rer1Q9CQU3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms