Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PompQ9CQT5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PompQ9CQT5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms