Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQM1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQM1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms