Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mrpl35Q9CQL6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl35Q9CQL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl35Q9CQL6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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