Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdm1Q9CQK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms