Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms