Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudt21Q9CQF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms