Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms