Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms