Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms