Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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