Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms