Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms