Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms