Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms