Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc18Q9CQ07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc18Q9CQ07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms