Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT4

Mydgf, Myeloid-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MydgfQ9CPT4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MydgfQ9CPT4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MydgfQ9CPT4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MydgfQ9CPT4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms