Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt88Q9CPR6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms